Bahía de Santa Cruz es el corazón de Huatulco. La actividad gira en torno a su dársena, donde atracan los yates y las embarcaciones turísticas. Está rodeada de tiendas, pequeños restaurantes y operadores turísticos. Si te interesa contratar alguna excursión de vela o esnórquel, éste es el sitio para hacerlo. De aquí salen también los catamaranes y tours colectivos que visitan siete de las nueve bahías; hacen paradas para practicar esnórquel, buceo y observación de la fauna marina (estos tours duran entre cinco y siete horas). También podrás practicar rafting en el hermoso y poco conocido río Copalita, así como jet ski, windsurf, kayak, rapel y tirolesa.

Si te apetece un tour personalizado, puedes inscribirte a un tour en moto acuática, con un recorrido similar y puedes ir deteniéndote donde tú le indiques al guía. En la misma bahía de Santa Cruz se encuentra un muelle para cruceros, que recibe por lo menos un barco grande a la semana. Al centro de la bahía, detrás de la pequeña Capilla de la Santa Cruz verás la playa de Santa Cruz, que es una de las más populares y concurridas, pues sus características la hacen muy recomendable para que los niños naden.